(之前在檢視瀏覽這裡時，發現第二季的分集少了後面13~23的集數內容，但在搬過來這裡前有先看過是有這篇的，應該是搬家過程時出現了異常缺文，因此在這裡補上)
13.疑犯
萊納在路德公館中被人槍擊重傷，同時警方也發現到強納森醉倒在卡車中，手裡拿著使用過的槍，使得強納森當場被懷疑是嫌疑犯；但路德集團的一位執行董事表示兇手可能是雷克斯，因為萊納收購了雷克斯的公司，但雷克斯卻向克拉克表示兇手可能是那位執行董事，因為他一回到公司，執行董事的工作就會不保，克拉克不知道該相信誰，他決定自己親自找出兇手，證明父親的清白!
14.膽大包天
幾名青少年在卡瓦契洞穴舉行一場派對，但卻有人因為過度興奮而死亡，而他們的脖子上都有被刺傷的小痕跡，彼得和克洛伊也都被刺傷，彼得變得十分粗魯，甚至放了紅氪石在克拉克身上，使得克拉克當場個性大變，甚至和克洛伊調情刺激了蘭娜，連雷克斯也對他的行為感到懷疑，他雇了一位教授沃登博士做調查，後來才發現這一切都是洞穴裡的一種不明寄生蟲所引起，必須將寄生蟲從體內取出才會恢復正常…
15.浪子
雖然萊納對外聲稱私生子盧卡斯已經死亡，但雷克斯卻發現他還活著，並把他帶回小鎮，萊納對雷克斯的行為很生氣，決定凍結他的一切，把他趕出去，使得雷克斯不得不在肯特農場生活，並幫忙做工。同時盧卡斯宣稱接管了雷克斯所有的財產，也包含了塔龍咖啡館，甚至叫蘭娜走路!另一方面，克拉克發現到萊納其實早就接觸過盧卡斯，利用他策劃了收購雷克斯公司的計畫，此時，雷克斯、盧卡斯也分別開始懷疑萊納的失明是假的，並打算進行試探…….
16.熱病
瑪莎在地窖裡埋藏八角形鑰匙時，感染了不明綠色物質而昏迷，醫生在檢查時表示要通報疾病管制局，還有另一個消息是瑪莎懷孕了!!瑪莎向強納森和克拉克表示，可能是當時暴風雨時，太空船啟動時的放射能量治好了她的不孕症，而她偷藏八角形鑰匙是怕克拉克離開!由於疾病管制小組將在農場搜索，克拉克緊急將太空船移走，但他也感染到了綠色毒素，而力量衰弱!強納森發現治好瑪莎和克拉克的方法是啟動太空船，但鑰匙被疾病管制小組扣留，唯一的辦法是將它偷回來!!
17.解密鑰石
克拉克在洞穴中企圖用八角形鑰匙開啟密室，在開啟過程中克拉克明白了洞中文字的含義，當他清醒時卻被雷克斯發現躺在路上。由於克拉克意外超能力失控，在穀倉內留下了標記，克洛伊將標記登上報紙後，克拉克接到了一封史旺恩博士(克里斯多夫李維客串)的來信，信中提到了洞中符號，而吸引了克拉克前往大都會尋找史旺恩博士，從史旺恩博士13年前所接到的外星訊息上得知自己的由來和身分，但當他開啟太空船時，生父遺留的訊息卻告訴他，他來地球的目的是征服人類………
18.訪客
小鎮高中新來一名轉學生賽勒斯，由於個性怪異又孤僻，成為校內壞學生的欺負對象。克洛伊向克拉克表示，賽勒斯很怪異的地方是他曾經告訴同學自己是外星人，克拉克接近他，他卻說自己是流星雨那天送到地球來的!瑪莎偷偷聯繫雷克斯的醫生女友海倫做定期檢查，海倫對於瑪莎的痊癒感到疑惑。另一方面，海倫在路德公館中，意外發現了某個秘密房間；裡面居然是對於克拉克一家人的調查報告!此時，賽勒斯告訴克拉克，要發信號聯絡外星球的父母接他回去，希望他能幫忙!!
19.災難
蘭娜在塔龍咖啡館被幾位男生調戲，克拉克趕到時失手把其中一位叫安迪的扔到新任女警長南茜的車上，被安迪家的人要求索賠，否則提告。蘭娜很感謝克拉克，但她還是認為應該試著自己保護自己，不再依賴克拉克。同時，雷克斯的女友海倫醫生的前任男友保羅意外出現，但雷克斯對於保羅的舉動感到不舒服，而保羅對於雷克斯和海倫之間的感情產生嫉妒，故意弄傷自己，慌稱是雷克斯為，甚至還打傷海倫，雷克斯發狂似地想尋找他，克拉克怕他出亂子，只好跟著他。
20.目擊證人
一群戴著面具的劫匪搶了路德集團的運輸車，克拉克剛好經過，企圖阻止匪徒時發現對方擁有和自己一樣的能力。在調查時，克拉克發現其中一名劫匪是校內的學生艾力克，為了跟蹤他而來到鑄煉廠，但克拉克卻被發現而遭突襲。逃出來的克拉克向警方舉報後，回家時發現自己的父母被綁、穀倉也被破壞，但雷克斯探望獄中的艾力克時，卻表示要將他保釋出來，條件是要告訴他運輸車上的物品……
21.加速
蘭娜意外在咖啡館見到小時候溺水死亡的好友艾蜜莉，而嚇了一跳!克拉克為了解開蘭娜的疑惑，親自去造訪艾蜜莉的父親丁斯莫，已證實她確實死亡。原來當時艾蜜莉看到蘭娜溺水時，不知道蘭娜會游泳而自己也跳下去導致自己死亡，使得蘭娜愧疚；同時雷克斯在病房探望受傷的丁斯莫也意外發現艾蜜莉的存在，克拉克在透視艾蜜莉的墳墓時也發現墳墓是完整的，並且在艾蜜莉家中的地下室發現好幾具艾蜜莉的複製人，原來路德集團在研究複製人，丁斯莫也正在研究加速生長的試劑。
22.召喚
原本在調查卡瓦契洞穴，但卻意外昏迷的沃登博士醒來了，但他的手卻能放出光線，回到洞穴時甚至還打開了洞穴牆壁，並對著牆上一個男人的影像念著：我知道你是誰。克拉克無意中聽到一個聲音對他說：「這一天終於到了。」他追隨著聲音來到洞穴，遇見萊納，萊納想要套出克拉克的秘密，但克拉克不理會他。此時，沃登博士來到路德公館，向萊納、雷克斯表示，克拉克是洞穴文字指的人，表示要消滅克拉克。海倫的辦公室被闖入，克拉克的血清樣本被偷，讓肯特夫婦相當擔心。
23.出走
克拉克的太空船放出訊息，它隱藏著克拉克生父喬艾爾的一段記憶，告訴了克拉克他的真名是凱艾爾，要他離開小鎮探索自己的命運，但克拉克不答應，身上卻被留下了祖先的標記。雷克斯向海倫表示是自己偷了她的辦公室，讓她氣得想取消婚禮。克拉克前往洞穴，發現萊納根據沃登博士手上的印記用氪石複製了一把鑰匙，決定利用這個複製的鑰匙毀掉太空船，擺脫掉生父的控制。但沒想到，太空船摧毀的同時，地窖也發生了大爆炸，所引起的能量波讓瑪莎和強納森翻車，也使得瑪莎的胎兒不保，強納森也對著克拉克發怒!!自責的克拉克陷入狂亂，他戴上了紅氪石戒指，決定離開小鎮；此時，雷克斯的婚禮結束後，他和海倫坐飛機度蜜月，當喝酒昏迷的雷克斯醒來時，發現機上只剩自己一人，飛機也即將墜毀……….
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